对于新生儿来说，乙肝疫苗的起效时间可能因个体差异而异，一般在接种后3-6个月。
乙肝疫苗通过刺激机体产生表面抗体，即HBsAb，来提供对乙肝病毒感染的保护。新生儿在出生时接种乙肝疫苗，通常在接种后3个月内可产生有效保护作用，这是因为新生儿期机体免疫系统处于建立阶段，对疫苗的反应较为敏感。对于个体免疫反应较差或存在免疫抑制性疾病的人群，如HIV感染或正在接受免疫抑制治疗的人群，其产生保护性抗体的时间可能延长至6个月或更久。
密切观察接种部位的反应，如出现红肿、硬结或发热等情况，应及时就医。
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